Un determinado cruce o apareamiento se dice consanguíneo cuando los dos miembros de la pareja tienen un antecesor o más comunes.
En la cría de animales de raza en general, se ha venido haciendo siempre uso de la consanguinidad como medio para tratar de fijar determinadas características deseadas en la descendencia y unos rasgos particulares de la propia raza de que se tratase. A partir de un ejemplar que presentase las peculiaridadess anatómicas, psicológicas o utilitarias que interesaban al hombre, se han realizado cruzamientos entre sus descendientes, con el objeto de que las sucesivas generaciones presentaran esas mismas dotes. La explicación es bien sencilla; se pretende con este método conseguir la homocigosis para determinados genes, responsables de los caracteres fenotípicos buscados, lo que redundaría en la fijación de éstos en la herencia genética.
Mediante la consanguinidad se han conseguido perpetuar determinadas mutaciones genéticas, dando así origen a nuevas razas y variedades.
En el caso de la raza canina que nos ocupa, el perro de pastor alemán, se logró crearla a partir de unas razas preexistentes (Véase la historia de la raza), hasta que se consiguió un ejemplar que cumplía con las preferencias de los criadores. A partir de ahí, se utilizó la consanguinidad sobre este ejemplar ("Horand von Grafrath"), cruzando entre sí a él y a sus descendientes, hasta lograr fijar su fenotipo en todos ellos. Todos, absolutamente todos los pastores alemanes de hoy descienden de "Horand".
Posteriormente, cada vez que ha surgido un perro con los rasgos deseados, se han vuelto a realizar cruces consanguíneos en él, convirtiéndose estos ejemplares en el origen de lo que se han denominado las diferentes "líneas de sangre" dentro de la raza.

Pero la consanguinidad entraña también el riesgo de fijar características no deseadas, además de disminuir el vigor de los animales. Por ello, tras algunos fracasos ostensibles, se vió la necesidad de limitar las consanguinidades, y el SV (Club alemán de la raza) implantó nuevas normativas de crianza.
En la actualidad, mientras en otras razas caninas no hay limitaciones a esta práctica de crianza, todos los Clubes afiliados a la WUSV (Unión Mundial de Clubes del Pastor Alemán) no permiten cruzamientos con una consanguinidad inferior a  2-3 ó 3-2, denegando el tatuaje a los perros fruto de camadas con una consanguinidad inferior a este grado, que a continuación vamos a ver cómo se determina.

La manera de "medir" la consanguinidad es señalando las generaciones en las que aparece un antecesor común.

Supongamos que en el pedigree anterior el individuo con el nº 3 (abuelo paterno) es el mismo que el individuo nº 5 (abuelo materno). La consangunidad sería 2-2 (2º generación por parte del padre - 2ª generación por parte de la madre). 
Esta consangunidad no estaría permitida por la WUSV.

Otro ejemplo: 
Supongamos ahora que el individuo 4 (abuela paterna) es el mismo que el 12 (bisabuela paterno-materna). La consanguinidad sería 2-3 (2ª generación por parte del padre-3ª generación por parte de la madre). 
(Esta consanguinidad sí está permitida para el pastor alemán).
Véase la tabla siguiente:

Un ejemplo más:
Supongamos que el individuo 7 es el mismo que el 27.
La consanguinidad se diría 3-4 (3ª generación por parte del padre y 4ª generación por parte de la madre).
Véase la tabla siguiente:

Naturalmente, puede haber más de una consanguinidad en un mismo pedigree.
En este caso se señalarán todas las que existan, sobre cada uno de los individuos que aparezcan "repetidos" dentro de él.
Si, por ejemplo, se dieran simultáneamente los dos casos anteriores, es decir, que la perra 4 sea la abuela paterna y también la bisabuela paterno-materna, y a la vez el perro 7 sea bisabuelo del padre y a la vez tatarabuelo de la madre, coexistirán ambas consanguinidades, ésto es habrá una consanguinidad 2-3 en el individuo 4 y una consanguinidad 3-4 en el individuo 7.
Véase la siguiente tabla:

Puede también darse el caso de que un mismo individuo aparezca varias veces en el pedigree, existiendo entonces una múltiple consanguinidad sobre él. Es decir, pudiera darse un caso como el siguiente: Que el individuo 7 sea el mismo que el 19, que el 5 y que el 13.
El convenio entonces es señalar las consanguinidades paternas separadas por comas, al igual que las maternas, también separadas por comas, y con un guión entre unas y otras.
En el caso comentado la consanguinidad sería entonces: 3,4-2,3 en el individuo 7 (ya que aparece en la 3ª y 4ª generación por parte del padre y en la 2ª y en la 3ª por parte de la madre). Véase la tabla siguiente:

Otro ejemplo, que ya no comentamos, y que se puede ver gráficamente en la siguiente tabla sería éste:

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La consanguinidad sobre hermanos se considera de la misma forma que si se tratase del mismo individuo.
Si, por ejemplo, 4 fuese hermana de camada de 12, se hablaría de una consanguinidad 2-3 sobre la camada en cuestión.
Como en Alemania es usual distinguir las camadas por una inicial por la que comienzan los nombres de todos sus integrantes, se hablaría de una consanguinidad 2-3 en la camada "Q" von Arminius, suponiendo que estas perras fueran llamadas "Quana v.Arminius" y "Quina v.Arminius", miembros ambas de la misma camada "Q".

Los cruces con este tipo de consanguinidades secundarias, es decir, en hermanos de padre y madre, tienen el mismo tratamiento. No están permitidas las consangunidades inferiores a 2-3 ó 3-2 en perros que sean hermanos de padre y madre. Y hablamos de hermanos de padre y madre porque no tienen por qué ser hermanos de la misma camada.
Por ejemplo, si el individuo 7 fuera "Esko vd. Wienerau", hijo de "Zamb vd. Wienenrau" y de "Xandra vd.Wienerau", y la perra 12 fuera "Vanta vd. Wienerau", hija de los mismos padres que "Esko", pero de otra camada nacida anteriormente, existiría también una consanguinidad 3-3 en Esko-Vanta vd. Wienerau. Véase la tabla siguiente:

Por último, también suelen señalarse las consanguinidades unilaterales (por parte del padre solamente, o por parte de la madre solamente) en algún perro bien significativo. En este caso se asigna un 0 a la parte que no tiene a ese individuo en su pedigree.
Por ejemplo, si el individuo 7 fuera el mismo que el 21, se señalaría una consanguinidad 3,4-0 en él.
O en el caso de que 6 fuese la misma perra que 26, se diría que hay una consanguinidad 0-2,4 en ella.
Véase la tabla siguiente:

Los pedigrees alemanes reflejan siempre las consanguinidades hasta la quinta generación, siempre expresadas en este sistema que acabamos de analizar.

Para "medir" consanguinidades existe también otro método, consistente en expresarlas por medio de un COEFICIENTE DE CONSANGUNIDAD.
Éste se define como la probabilidad de que  un individuo sea homocigótico para un par de alelos determinados transmitidos por un antecesor común, o dicho de otro modo, la probabilidad de que un alelo transmitido por el padre sea idéntico al transmitido por la madre, teniendo ambos éste como legado de un ancestro común.
Fue Sewell Wrigth, científico norteamericano, el que propuso en 1.922 una fórmula matemática para definir la consanguinidad, y posteriormente el inglés Malcom B.Willis trató de  simplificarla para acercarla a los criadores poco avezados en las matemáticas.
El fundamento para llegar hasta ella es algo complejo, aunque también algo comprensible de forma intuitiva
. Cualquier ser vivo posee en sus genes la mitad procedente del padre y la otra mitad de la madre. Así, pues, ciualquier individuo tendrá la mitad (1/2) de "sangre" de cualquiera de sus padres, y la probabilidad de que herede un determinado alelo .paterno será del 50%.
De la misma forma, se podrá decir que tiene la mitad de la mitad, o sea una cuarta parte (1/4 = 1/2 x 1/2) de "sangre" de uno cualquiera de sus abuelos, o lo que es lo mismo, sólo un 25% de probabilidad de heredar uno de sus alelos..
Tratándose de un bisabuelo (3ª generación), tendrá 1/8 = 1/2 x 1/2 x 1/2 de probabilidad de tener "sangre" suya.
Por lo tanto, de un antepasado que aparezca en la generación enésima, tendrá (1/2 x 1/2 x1/2 x ....... x 1/2) = (1/2)ⁿ de probabilidad de heredar uno de sus alelos..

Por ésto la fórmula simplificada que dá el porcentaje de consanguinidad de un perro X con un antepasado común en la generación n1 por el lado paterno, y en la generación n2 por el lado materno es :

F(X) = (1/2)^{n1 + n2 - 1}

Así, en el caso de un acoplamiento padre-hija o madre-hijo (consanguinidad 1-2), el coeficiente sería:
F(X) = (1/2)^{1 + 2 -1} = (1/2)² = 1/4 = 0,25
es decir, el individuo tiene una probabilidad del 25% de ser homocigótico en el locus correspondiente, con dos alelos idénticos procedentes del antecesor común, en este caso del padre y abuelo a la vez.

Si habláramos de una consanguinidad (2-3) sería:
F(X) = (1/2)^{2 + 3 - 1} = (1/2)⁴ = 1/16 = 0.0625
es decir, una probabilidad del 6,25% de haber heredado el mismo alelo por ambas partes.
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En el caso de haber una doble  consanguinidad entre el padre y la madre, ésto es, dos ancestros comunes, los respectivos coeficientes se adicionarían. Por ejemplo, con una consanguinidad (2-3) en un antepasado y otra (3-3) en otro, el índice sería:
F(X) = (1/2)^2+3-1 + (1/2)^3+3-1 = (1/2)⁴ + (1/2)⁵ = 1/16 + 1/32 = 3/32 = 0,09375
o 9,375% de probabilidades de ser homocigótico.

La fórmula para este coeficiente en el caso de múltiples consanguinidades se hace más compleja cuanto más consanguinidades existan.
La fórmula general sería ésta:

F(X) = S_j (1/2)^{S_i n_i - 1} . [1 + F_j(A_j)]

donde n_i son las generaciones en las que aparezca cada individuo A_j, y  donde F_j(A_j) son los coeficientes de consanguinidad que estos antecesores posean por sí mismos.